搞生信的人一定要知道的小鼠(MGI)数据库

微沙随浪

Mouse Genome Informatics (MGI) 数据库

Mouse Genome Informatics (MGI) 是由美国杰克逊实验室创建的一个关于小鼠基因组学、遗传学和生理学的公共数据库。该数据库致力于整合、解析和传达有关小鼠模型、小鼠基因组、小鼠表型特征和疾病模型等方面的信息，为生命科学研究人员提供重要的支持和参考。
MGI 数据库包含了三个主要的组成部分：

• 遗传学和基因组学数据：
  包括小鼠基因组学、基因、突变体等基因遗传学的信息、小鼠基因表达谱以及小鼠基因底物、信号传导通路等方面的信息。
  
• 表型特征数据：
  包括小鼠整体表型特征、器官特征、细胞特征、代谢表型、行为表型等方面的信息。
  
• 疾病模型数据：
  包括小鼠疾病模型的基本信息、疾病相关的基因、表型特征、基因-表型-环境互作网络等方面的信息。
  

MGI 数据库的主要功能主要分为四个方面：

• 浏览和搜索：
  用户可以在 MGI 数据库中浏览和搜索各种信息，如基因、突变体、表型、疾病模型等。
  
• 数据下载：
  用户可以选择合适的数据集进行下载，并获取所需数据的详细说明和文档。
  
• 工具和资源：
  MGI 还提供了一些工具和资源，如基因比较、编码序列检索、小鼠遗传学术语表、小鼠表型测量手册等。
  
• 数据注释：
  MGI 对用户提交的数据进行注释，以使其更好地被广泛使用。
  

MGI 数据库提供了多种数据下载方式：

• FTP下载：
  

用户可以通过FTP方式下载所需的数据。具体方法是，进入MGI数据库官网（http://www.informatics.jax.org/），点击页面上方的“Download”按钮，在弹出的下载菜单中选择FTP下载，并根据需要选择相应的文件类型和版本号进行下载。

• 数据库工具下载：
  

MGI 数据库提供一些工具和软件供用户下载，如基因比较软件、小鼠遗传学术语表等。具体方法是，进入MGI数据库官网，点击页面上方的“Tools & Resources”按钮，找到所需的工具或软件，然后点击“Download”按钮进行下载。

• Web接口下载：
  

用户可以直接从MGI数据库的Web接口上下载所需的数据。具体方法是，进入MGI数据库官网，搜索或浏览所需的数据，然后选择导出格式进行下载。

• 邮箱订阅下载：
  

用户可以订阅MGI数据库更新的邮件通知，当有新数据更新时，系统会自动发送邮件通知到用户的注册邮箱，用户可以通过邮件中的链接下载所需的数据。
需要注意的是，使用MGI数据库下载任何数据前，用户需要仔细阅读和遵守该数据库的数据使用和共享协议。同时，对于某些受版权保护的数据，用户还需要获得相关数据提供者的授权才能进行下载和使用。
在生命科学研究领域，MGI 是一个重要的、可靠的资源库。它为小鼠模型的研究人员提供了全面而可信的数据和信息，支持开展基于小鼠模型的研究和发现新的治疗方法的应用。

朝暮青丝

支持楼主，用户楼主，楼主英明呀！！！

宗介喜欢炖鱼

发发呆，回回帖，工作结束~

花生壳

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杨庆香

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